Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MFSD3Q96ES6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MFSD3Q96ES6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MFSD3Q96ES6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MFSD3Q96ES6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MFSD3Q96ES6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MFSD3Q96ES6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MFSD3Q96ES6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MFSD3Q96ES6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MFSD3Q96ES6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms