Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPL39LQ96EH5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPL39LQ96EH5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms