Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC39Q96DD0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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LRRC39Q96DD0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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LRRC39Q96DD0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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LRRC39Q96DD0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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LRRC39Q96DD0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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LRRC39Q96DD0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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LRRC39Q96DD0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC39Q96DD0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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