Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OTUB2Q96DC9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OTUB2Q96DC9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OTUB2Q96DC9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms