Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EAF2Q96CJ1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EAF2Q96CJ1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms