Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RFT1Q96AA3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RFT1Q96AA3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms