Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNX21Q969T3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SNX21Q969T3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms