Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP2A3Q93084 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP2A3Q93084 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms