Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNRQ92752 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNRQ92752 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNRQ92752 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNRQ92752 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNRQ92752 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
TNRQ92752 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNRQ92752 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNRQ92752 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNRQ92752 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TNRQ92752 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNRQ92752 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNRQ92752 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNRQ92752 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
TNRQ92752 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNRQ92752 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNRQ92752 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNRQ92752 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNRQ92752 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNRQ92752 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TNRQ92752 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNRQ92752 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNRQ92752 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNRQ92752 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNRQ92752 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNRQ92752 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNRQ92752 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNRQ92752 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNRQ92752 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNRQ92752 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNRQ92752 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNRQ92752 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNRQ92752 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TNRQ92752 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNRQ92752 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNRQ92752 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNRQ92752 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNRQ92752 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNRQ92752 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TNRQ92752 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNRQ92752 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNRQ92752 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TNRQ92752 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TNRQ92752 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNRQ92752 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNRQ92752 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
TNRQ92752 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNRQ92752 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNRQ92752 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNRQ92752 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNRQ92752 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNRQ92752 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TNRQ92752 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNRQ92752 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TNRQ92752 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
TNRQ92752 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TNRQ92752 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
TNRQ92752 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TNRQ92752 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNRQ92752 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNRQ92752 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
TNRQ92752 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNRQ92752 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNRQ92752 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNRQ92752 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNRQ92752 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TNRQ92752 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNRQ92752 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNRQ92752 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNRQ92752 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNRQ92752 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNRQ92752 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNRQ92752 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNRQ92752 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNRQ92752 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNRQ92752 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNRQ92752 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNRQ92752 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNRQ92752 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNRQ92752 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TNRQ92752 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNRQ92752 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNRQ92752 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNRQ92752 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNRQ92752 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNRQ92752 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNRQ92752 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
TNRQ92752 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNRQ92752 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TNRQ92752 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNRQ92752 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNRQ92752 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNRQ92752 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNRQ92752 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNRQ92752 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TNRQ92752 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNRQ92752 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TNRQ92752 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TNRQ92752 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
TNRQ92752 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms