Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GTF3AQ92664 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GTF3AQ92664 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms