Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NCSTNQ92542 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NCSTNQ92542 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms