Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SUSD6Q92537 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUSD6Q92537 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUSD6Q92537 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms