Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CTTNBP2Q8WZ74 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CTTNBP2Q8WZ74 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CTTNBP2Q8WZ74 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CTTNBP2Q8WZ74 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CTTNBP2Q8WZ74 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms