Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4AQ8WYN0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATG4AQ8WYN0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms