Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSPC1Q8WXF1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSPC1Q8WXF1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
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