Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCG3Q8WXD2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCG3Q8WXD2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms