Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PALLDQ8WX93 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PALLDQ8WX93 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PALLDQ8WX93 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALLDQ8WX93 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PALLDQ8WX93 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms