Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOBEC4Q8WW27 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOBEC4Q8WW27 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms