Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVR3

C7orf43, Uncharacterized protein C7orf43, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43Q8WVR3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C7orf43Q8WVR3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
C7orf43Q8WVR3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C7orf43Q8WVR3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms