Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
TRIM41Q8WV44 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
TRIM41Q8WV44 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRIM41Q8WV44 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms