Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SSH3Q8TE77 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SSH3Q8TE77 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SSH3Q8TE77 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms