Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATL2Q8NHH9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATL2Q8NHH9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATL2Q8NHH9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms