Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC148Q8NFR7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC148Q8NFR7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms