Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCPH1Q8NEM0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCPH1Q8NEM0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms