Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LINC00116Q8NCU8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC00116Q8NCU8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms