Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AVL9Q8NBF6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AVL9Q8NBF6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
AVL9Q8NBF6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AVL9Q8NBF6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AVL9Q8NBF6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AVL9Q8NBF6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AVL9Q8NBF6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AVL9Q8NBF6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AVL9Q8NBF6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AVL9Q8NBF6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
AVL9Q8NBF6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
AVL9Q8NBF6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AVL9Q8NBF6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
AVL9Q8NBF6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms