Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB37

GATD1, Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1Q8NB37 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATD1Q8NB37 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATD1Q8NB37 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATD1Q8NB37 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATD1Q8NB37 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GATD1Q8NB37 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms