Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHCHD4Q8N4Q1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHCHD4Q8N4Q1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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