Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P6

LRRC71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71Q8N4P6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC71Q8N4P6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC71Q8N4P6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms