Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RYBPQ8N488 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RYBPQ8N488 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms