Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC43Q8N309 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC43Q8N309 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC43Q8N309 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRRC43Q8N309 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC43Q8N309 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms