Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KRTAP1-3Q8IUG1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KRTAP1-3Q8IUG1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms