Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NME9Q86XW9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NME9Q86XW9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms