Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPFIBP1Q86W92 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPFIBP1Q86W92 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms