Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCA5Q86VQ0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCA5Q86VQ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms