Protein–RNA interactions for Protein: Q86UX7

FERMT3, Fermitin family homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT3Q86UX7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FERMT3Q86UX7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FERMT3Q86UX7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms