Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP3Q7RTS5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OTOP3Q7RTS5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.9 ms