Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP1Q7RTM1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP1Q7RTM1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms