Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
USP34Q70CQ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
USP34Q70CQ2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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