Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00299Q6ZSB3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00299Q6ZSB3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms