Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf47Q6ZRZ4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf47Q6ZRZ4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms