Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNE3Q6ZMZ3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNE3Q6ZMZ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms