Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FOXD4L3Q6VB84 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FOXD4L3Q6VB84 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms