Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMBR1LQ6UX01 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMBR1LQ6UX01 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1LQ6UX01 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1LQ6UX01 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1LQ6UX01 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1LQ6UX01 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1LQ6UX01 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMBR1LQ6UX01 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMBR1LQ6UX01 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMBR1LQ6UX01 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMBR1LQ6UX01 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMBR1LQ6UX01 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMBR1LQ6UX01 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LMBR1LQ6UX01 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LMBR1LQ6UX01 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LMBR1LQ6UX01 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms