Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ABRAXAS1Q6UWZ7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms