Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A10Q6U841 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.51■■■□□ 2
SLC4A10Q6U841 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A10Q6U841 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms