Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCE2Q6PIF2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYCE2Q6PIF2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms