Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMF1Q6P1K2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMF1Q6P1K2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMF1Q6P1K2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMF1Q6P1K2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMF1Q6P1K2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMF1Q6P1K2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMF1Q6P1K2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMF1Q6P1K2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMF1Q6P1K2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms