Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT4

SLC30A6, Zinc transporter 6, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A6Q6NXT4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC30A6Q6NXT4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC30A6Q6NXT4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC30A6Q6NXT4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC30A6Q6NXT4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC30A6Q6NXT4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC30A6Q6NXT4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC30A6Q6NXT4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC30A6Q6NXT4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC30A6Q6NXT4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC30A6Q6NXT4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC30A6Q6NXT4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms