Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD54Q6NXT1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD54Q6NXT1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms